135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2172 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2172  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 478 aa  877    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  hitchhiker  0.0000450319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  60.56 
 
 		 465 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  39.29 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  31.42 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  31.42 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  31.42 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  30.81 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  29.48 
 
 		 412 aa  123  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  27.93 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.64 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  27.38 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.86 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  30.52 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.92 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.92 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.11 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.12 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.69 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.77 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.86 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.11 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.27 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  21.85 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  21.85 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.09 
 
 		 1833 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  22.71 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  23.93 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0377  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.27 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.27 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.69 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  24.55 
 
 		 1816 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  20.16 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.9 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  21.83 
 
 		 410 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  21.2 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  27.35 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  20.64 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  19.89 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 428 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.15 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  29 
 
 		 901 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.34 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  27.34 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 390 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  27.27 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  27.27 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  19.22 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.36 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  22.88 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  28.94 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.22 
 
 		 414 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>