49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1339 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  76.08 
 
 		 408 aa  564  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  76.84 
 
 		 404 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  52.54 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  52.54 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  52.54 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  56 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  56.53 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  32.41 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  25.61 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  25.61 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  25.61 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.5 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  26.5 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  29.47 
 
 		 452 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.67 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.5 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.14 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.5 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.5 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0953  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.5 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.5 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  36.26 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  36.26 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  28.8 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  36.26 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.54 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  19.66 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  19.66 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  26.42 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  30.92 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.24 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  19.72 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 432 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>