35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5652 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  98.5 
 
 		 400 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  98.5 
 
 		 400 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  61.93 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  54.29 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  52.57 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  25.43 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  25.43 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  25.43 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3504  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  25.07 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  26.15 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  26.15 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  26.15 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  29.69 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  26.43 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  26.52 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 499 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.54 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>