60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3616 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  803    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3493  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  27.25 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  26.3 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  29.17 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  29.17 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  29.17 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  32.52 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  29.57 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  29.57 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.71 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  26.67 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  24.86 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  32.63 
 
 		 1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.71 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  22.71 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  22.71 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  27 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  22.71 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.38 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  22.42 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  20.34 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  25.44 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.32 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>