22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2532 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  99.26 
 
 
430 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  89.9 
 
 
406 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  99.67 
 
 
328 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  99.67 
 
 
304 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  99.67 
 
 
304 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2147  major facilitator family protein  87.1 
 
 
62 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  26.29 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  24.86 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  24.65 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  24.81 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  25.36 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  25.36 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  26.27 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  26.99 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  25.28 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3167  hypothetical protein  96.61 
 
 
59 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0439937  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  24.78 
 
 
400 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
499 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3616  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>