19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3168 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1645  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2146  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3168  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0709352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2672  hypothetical protein  99.67 
 
 
430 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2585  hypothetical protein  99.67 
 
 
406 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.848576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2532  hypothetical protein  99.67 
 
 
406 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1949  hypothetical protein  88.89 
 
 
406 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1271  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  25.19 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3279  major facilitator transporter  26.64 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173612  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3716  major facilitator transporter  26.92 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4652  major facilitator transporter  26.92 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17095  normal  0.978132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3362  major facilitator transporter  25.36 
 
 
404 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5029  major facilitator transporter  28.68 
 
 
406 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.973575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5652  major facilitator transporter  26.15 
 
 
400 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618136  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  26.05 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5457  major facilitator transporter  23.62 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231481  normal  0.0222547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  36.26 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>