184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4617 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 455 aa  858    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  31.82 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  34.05 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  28 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 435 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  28.64 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  28.87 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.02 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.06 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.89 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.31 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.66 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.31 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.66 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3650  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  32.54 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.88 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  19.35 
 
 		 1833 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  33.49 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  24.22 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  24.22 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  31.62 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  26.49 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  30.88 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.36 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  30.82 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  34.55 
 
 		 194 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  27.27 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.78 
 
 		 1876 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  29.58 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.63 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.87 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.48 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  17.83 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.5 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>