58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0867 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  100 
 
 
321 aa  611  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  33.73 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
432 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  31.3 
 
 
417 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  34.51 
 
 
443 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 
429 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  34.35 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  34.35 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  34.41 
 
 
431 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  35.63 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  32.56 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
462 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  33.33 
 
 
443 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  27.35 
 
 
412 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
423 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
444 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
459 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  31.68 
 
 
464 aa  59.3  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.51 
 
 
1833 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.27 
 
 
417 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
455 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
420 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
432 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
409 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
440 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.08 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
414 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.81 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
424 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.56 
 
 
448 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  23.31 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2297  putative membrane transport protein  42.05 
 
 
163 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09765  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  30.26 
 
 
425 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.15 
 
 
1839 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  32.53 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  32.53 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  32.53 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.71 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
401 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  31.33 
 
 
420 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  31.33 
 
 
420 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  31.33 
 
 
420 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  28.24 
 
 
412 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  20.63 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.18 
 
 
406 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  31.33 
 
 
194 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
431 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>