35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2297 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2297  putative membrane transport protein  100 
 
 		 163 aa  303  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  42.73 
 
 		 418 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  43.01 
 
 		 431 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  40 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  40 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  40 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  38.82 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  38.82 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  40 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  40 
 
 		 420 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  36.47 
 
 		 420 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  36.47 
 
 		 420 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  51.61 
 
 		 429 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 423 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  42.05 
 
 		 321 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 410 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 409 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 414 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 459 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 420 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  32.63 
 
 		 412 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 414 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 420 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 442 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  32.35 
 
 		 403 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 390 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 390 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  38.6 
 
 		 424 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  38.6 
 
 		 424 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 432 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 476 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>