More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4415 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  95.1 
 
 		 449 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  856    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  54.2 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 		 1833 aa  306  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  40.65 
 
 		 1816 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.27 
 
 		 1829 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.87 
 
 		 1876 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  32.97 
 
 		 414 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  29.86 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.03 
 
 		 1839 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.73 
 
 		 1806 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.74 
 
 		 1864 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.43 
 
 		 2720 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.94 
 
 		 1776 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 1769 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.92 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.31 
 
 		 927 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 472 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25.56 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  27.18 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  28.03 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  24.72 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  32.62 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.57 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.39 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.39 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  28.3 
 
 		 408 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.54 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  27.13 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.5 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  31.36 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.15 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  35.77 
 
 		 134 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.98 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.44 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 445 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.94 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.66 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.66 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.84 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.3 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.56 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  24.03 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.28 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.28 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  25.84 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.18 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.76 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  24.47 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.02 
 
 		 422 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.92 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.51 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.53 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>