74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05600  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 439 aa  825    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.94686 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05630  arabinose efflux permease family protein  34.24 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.264902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3357  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  20.09 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.32 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  29.39 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.26 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.61 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.94 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.26 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.94 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.94 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.94 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.38 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.73 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.86 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.62 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  22.16 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  25.77 
 
 		 541 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  21.65 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  27.51 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  20.64 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.57 
 
 		 526 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0377  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  21.87 
 
 		 410 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  21.96 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  20 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  20.21 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  24.74 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  21.96 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 524 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  30.71 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  28.4 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>