86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0849 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  100 
 
 
454 aa  886    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  81.37 
 
 
427 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  71.36 
 
 
427 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  71.36 
 
 
427 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  71.36 
 
 
427 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  65.48 
 
 
441 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
434 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
436 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  33.26 
 
 
436 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
434 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  35.96 
 
 
432 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
442 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 
427 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  35.56 
 
 
433 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  35.02 
 
 
432 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  34.31 
 
 
441 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
435 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  36.32 
 
 
450 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
431 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  33.09 
 
 
462 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
428 aa  118  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  31.2 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  24.5 
 
 
688 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  26.3 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  26.93 
 
 
529 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.5 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  24.19 
 
 
709 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  24.93 
 
 
505 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
451 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.6 
 
 
1816 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.67 
 
 
424 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.1 
 
 
686 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.65 
 
 
730 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.05 
 
 
688 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  31.79 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
426 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.56 
 
 
1833 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  24.34 
 
 
901 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
725 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  30.95 
 
 
405 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  25.82 
 
 
495 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
439 aa  50.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.92 
 
 
707 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  30.41 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  29.73 
 
 
427 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  31.33 
 
 
427 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
439 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.96 
 
 
1829 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
409 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.09 
 
 
1864 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.37 
 
 
471 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  28.69 
 
 
547 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  31.55 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.59 
 
 
1876 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  31.9 
 
 
662 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  27.87 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  26.44 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  29.14 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  25.28 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
727 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  28.57 
 
 
686 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  23.05 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.82 
 
 
426 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  31.67 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  24.86 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  33.33 
 
 
414 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  23.44 
 
 
512 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
476 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  21.5 
 
 
486 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>