299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4679 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5656  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 662 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.42 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  26.84 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.73 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 		 1833 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.73 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.66 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.77 
 
 		 1876 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.54 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.27 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.87 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  24.82 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  26.17 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.27 
 
 		 1829 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.66 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  28.95 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0659  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  21.89 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  29.73 
 
 		 707 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 725 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  36.99 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  20.92 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  29.86 
 
 		 703 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  26.47 
 
 		 730 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  21.96 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  22 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 705 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 686 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  26.96 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  22.85 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  22 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  21.32 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  29.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>