107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5656 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5656  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 662 aa  1319    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 409 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.55 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.55 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.78 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.06 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  32.05 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.78 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 427 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  21.73 
 
 		 362 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.97 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.69 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.97 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  20.82 
 
 		 393 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.1 
 
 		 1829 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 414 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.22 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.41 
 
 		 406 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 432 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.69 
 
 		 406 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  32.26 
 
 		 707 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 419 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.53 
 
 		 446 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 421 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.69 
 
 		 404 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.53 
 
 		 417 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 415 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 432 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  31.03 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.32 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 432 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  27.1 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  31.03 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  48.9  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 412 aa  49.3  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  30.41 
 
 		 535 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 416 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 450 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 440 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  30.17 
 
 		 415 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 415 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 463 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 390 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  25.32 
 
 		 415 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 412 aa  47.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  20.28 
 
 		 406 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.44 
 
 		 418 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 451 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 461 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 444 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  22.11 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.81 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  30 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.39 
 
 		 1876 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  28.95 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 401 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.49 
 
 		 1833 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.68 
 
 		 209 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  26.83 
 
 		 688 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 431 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 432 aa  44.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 415 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 427 aa  44.3  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 434 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 444 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 442 aa  43.9  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28 
 
 		 415 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>