More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0337 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
402 aa  780    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  35.57 
 
 
393 aa  238  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
405 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  31.14 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.45 
 
 
390 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.45 
 
 
390 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  25.67 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
415 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.14 
 
 
1829 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.34 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  27.12 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.66 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.43 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.68 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.41 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.42 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.38 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  24.04 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.43 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.91 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.81 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.93 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.39 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.16 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.55 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.31 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.55 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.9 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.15 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.16 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.21 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.9 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  26.01 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.77 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.16 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.96 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.81 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0170  major facilitator transporter  25.92 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  23.2 
 
 
1769 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  24.62 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.36 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.15 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.36 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  22.78 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.69 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
463 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.38 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.71 
 
 
1776 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  22.69 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.16 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
440 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.96 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.58 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  22.13 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  25.68 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  24.9 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  21.12 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  22.5 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.96 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  21.64 
 
 
1806 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  26.17 
 
 
560 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  28.88 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.72 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.45 
 
 
2720 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.22 
 
 
1876 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  23.66 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  23.58 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.93 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.73 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.17 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  23.2 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.93 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.01 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  21.45 
 
 
457 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  25 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  24.73 
 
 
438 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  24.92 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>