More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2831 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
486 aa  965    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  68.4 
 
 
482 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  68.4 
 
 
482 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  58.87 
 
 
462 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  57.2 
 
 
547 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  59.68 
 
 
459 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  57.65 
 
 
543 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  55.56 
 
 
522 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  53.06 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  44.67 
 
 
420 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
437 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  38.02 
 
 
415 aa  269  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  41.96 
 
 
459 aa  257  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  38.67 
 
 
471 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  39.56 
 
 
460 aa  236  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  36.03 
 
 
432 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
450 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
397 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.01 
 
 
709 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.99 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.99 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  24.55 
 
 
688 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  26.79 
 
 
730 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.47 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.47 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.65 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.65 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  24.31 
 
 
707 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.12 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  23.56 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.01 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.2 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.2 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.86 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.36 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23.56 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  21.96 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.94 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  23.66 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.66 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.47 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.73 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.57 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  25.16 
 
 
901 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.12 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.92 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.12 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.57 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.16 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.92 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.92 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.36 
 
 
1114 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
430 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.6 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.45 
 
 
1136 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.92 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.26 
 
 
1128 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.61 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.61 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
710 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.63 
 
 
419 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.77 
 
 
406 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
725 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.44 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.38 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  25.23 
 
 
686 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.38 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  23.64 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2492  putative ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.214398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.1 
 
 
419 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.1 
 
 
419 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.06 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  21.28 
 
 
427 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
463 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.24 
 
 
436 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
727 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2423  ABC transporter, permease protein, putative  21.76 
 
 
409 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2227  ABC transporter permease  21.76 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  23.72 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2393  ABC transporter permease  21.76 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0938241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>