22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 578 aa  1145    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  62.23 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 663 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  47.67 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  49.49 
 
 		 548 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 566 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  47.48 
 
 		 566 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 566 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  47.36 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 481 aa  257  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 598 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  37.19 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 449 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  37.98 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 529 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  36.8 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 491 aa  43.9  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>