More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3648 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  92.49 
 
 		 413 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.67 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.67 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.14 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.14 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.3 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 436 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  22.28 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  27.2 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0414  macrolide-efflux protein  22.5 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.743793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.42 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  24.8 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  29 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.62 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.88 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.81 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  29.7 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.33 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  25.48 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  21.54 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  28.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  25.9 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  22.04 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 710 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.21 
 
 		 1833 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  23.97 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  32.87 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  22.04 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.13 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28.21 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  21.51 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  22.83 
 
 		 559 aa  67  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 474 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.42 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>