258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0685 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  100 
 
 		 397 aa  797    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  60.1 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  59.85 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  59.6 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  51.65 
 
 		 398 aa  398  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  48.98 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  42.78 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  26.59 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  26.59 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  26.41 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  26.11 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.44 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25.31 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  22.58 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  22.67 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  22.31 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.86 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  22.18 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  26.16 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.51 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  22.81 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  22.77 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  22.77 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  22.77 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  23.99 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.27 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  21.93 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.28 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.56 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  22.48 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.56 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.07 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  22.48 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.42 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.56 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  22.25 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  22.48 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  23.29 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  21.93 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.45 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.28 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  19.11 
 
 		 1816 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  20.97 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.29 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  23.12 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>