More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44950 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  100 
 
 
567 aa  1155    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
426 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.44 
 
 
424 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.79 
 
 
404 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.79 
 
 
404 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.76 
 
 
404 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.33 
 
 
404 aa  94  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.43 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.33 
 
 
404 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  27.54 
 
 
686 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  22.92 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.42 
 
 
709 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
727 aa  77.8  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.29 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.25 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.15 
 
 
410 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  23.99 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  25 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.99 
 
 
1833 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  25 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  25 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.52 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  26.41 
 
 
405 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  31.91 
 
 
662 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
725 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  24.48 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  23.99 
 
 
730 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  24.74 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
410 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  22.96 
 
 
406 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
710 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  25 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  22.46 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  33.33 
 
 
688 aa  71.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.1 
 
 
686 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  25 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  30.73 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.18 
 
 
448 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  35.9 
 
 
707 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  22.22 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  22.78 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  22.6 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  21.65 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.22 
 
 
901 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.1 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  33.07 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.45 
 
 
432 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  30.21 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  27.6 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  21.19 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.95 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
453 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  27.6 
 
 
404 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  24.91 
 
 
642 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
446 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  25.76 
 
 
420 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
456 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.28 
 
 
439 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.47 
 
 
413 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  21.07 
 
 
402 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.47 
 
 
413 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  32.28 
 
 
417 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.67 
 
 
445 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  20.67 
 
 
397 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
425 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
439 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  30 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  32.28 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  30 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.65 
 
 
450 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.68 
 
 
703 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  23.77 
 
 
413 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  23.77 
 
 
413 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  24.57 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  23.56 
 
 
452 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  24.11 
 
 
1816 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  38.05 
 
 
707 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  22.84 
 
 
412 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.96 
 
 
705 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>