More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5044 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5044  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 447 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  29.06 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.43 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.65 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.92 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  28.05 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  30.79 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  30.59 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.04 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  21.79 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  31.12 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  29.68 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  24.93 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  29.09 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  29.77 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.06 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  27.52 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.44 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.44 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.33 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.54 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>