More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6319 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6319  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
403 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  42.34 
 
 
426 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  41.75 
 
 
423 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
405 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  37.21 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
390 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.99 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.53 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.53 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.53 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.88 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.99 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.61 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.24 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.26 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.52 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.37 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  31.21 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.1 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  27.04 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  26.58 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.54 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.61 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.34 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.42 
 
 
1876 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.85 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.03 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.65 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  31.52 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.59 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.59 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.13 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.14 
 
 
1833 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.68 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  25.68 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.68 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
446 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.3 
 
 
415 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.93 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  27.67 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  26.67 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  30.51 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  30.51 
 
 
495 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.82 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.82 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.9 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.03 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  26.17 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  26.98 
 
 
449 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.72 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  27.6 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  30.19 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.12 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.84 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
428 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.4 
 
 
411 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  23.12 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  29.77 
 
 
454 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  31.6 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>