More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1780 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
403 aa  774    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  45.37 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  42 
 
 
423 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6319  hypothetical protein  44.62 
 
 
397 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  35.93 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2672  putative permease  28.01 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.929224  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.96 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.96 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.08 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.19 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  26.97 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2374  macrolide efflux protein  28.29 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.19 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2449  permease  28.01 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2628  permease  28.01 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2646  putative permease  28.01 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000587034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2411  macrolide efflux protein  28.01 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.070182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.56 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22.94 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2512  major facilitator transporter  28.01 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2697  putative permease  27.73 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.94 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.7 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.8 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2655  permease, putative  28.01 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000943346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.65 
 
 
1833 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2652  putative permease  28.29 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.16 
 
 
447 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.5 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.36 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.41 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.14 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.59 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  20.62 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.12 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.03 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.54 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.03 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.65 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.03 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.53 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.2 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.5 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.87 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.4 
 
 
1816 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.23 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.79 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.14 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.08 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.08 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  27.48 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.46 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  24.46 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.59 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.34 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.69 
 
 
1829 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.34 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  32.33 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.45 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.07 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  25.58 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.79 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.57 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.4 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.47 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  32.02 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.29 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.81 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.81 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  27.51 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25.58 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.82 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>