149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3313 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2382  transporter, putative  97.78 
 
 		 434 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3313  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.437677 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.34 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.62 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  19.89 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  19.49 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.28 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.28 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.72 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.62 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.36 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  22.78 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  21.08 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  21.75 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  21.88 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  21.88 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  21.88 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  21.88 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  21.88 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  21.88 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  19.88 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  22.7 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2520  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2572  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  22.14 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  24.59 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.23 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.23 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  22.55 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.91 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  22.55 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1528  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  22.55 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.83 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.25 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.83 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  20.33 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.77 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.48 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.44 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  26.07 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  22.15 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  21.1 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.15 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.21 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  21.83 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.82 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.21 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 456 aa  46.6  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0422  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  20.3 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  26.52 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.4 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>