More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2572 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2572  major facilitator transporter  100 
 
 
358 aa  706    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2520  major facilitator transporter  100 
 
 
358 aa  706    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.79 
 
 
390 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.79 
 
 
390 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.14 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
428 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.15 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25 
 
 
412 aa  89.4  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.22 
 
 
474 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  21.9 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.75 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.94 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.41 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  24.86 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.59 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.59 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.59 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.59 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.59 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.59 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.07 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  22.91 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.29 
 
 
439 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  26.15 
 
 
420 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  21.28 
 
 
421 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.93 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  23.76 
 
 
499 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  22.82 
 
 
524 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  20.35 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.63 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  26.03 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  23.73 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.63 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  20 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  20 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.42 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.05 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.08 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.59 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  26.48 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  20.63 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.5 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.79 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.59 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.38 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  22.96 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  22.96 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  21.49 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.96 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  20 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.12 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.4 
 
 
462 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  25.45 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.38 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  23.18 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.3 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  20.5 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.7 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  25.45 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.92 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  21.16 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  26.09 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.3 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  26.21 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  26.21 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  24.05 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  19.49 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.92 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.7 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.83 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>