258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0422 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0422  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  809    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  31.25 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  28.57 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  28.12 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  28.12 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.25 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.25 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  28.71 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  27.68 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  25.63 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  24.62 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  28.96 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  24.74 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  22.01 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  25.93 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.3 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  28.25 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.94 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.16 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.47 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.16 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.17 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.17 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  23.16 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.04 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  26.63 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.18 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  23.16 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.64 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  24.63 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.72 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  24.63 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  24.63 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.72 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  23.5 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.37 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  23.5 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  25.27 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.23 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.72 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  26.61 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.63 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  23.5 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  27.72 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  22.91 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.31 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.39 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.18 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.31 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  23.74 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.74 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  27.6 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.53 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  27.4 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  27.4 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.69 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.69 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  26.56 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  22.76 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.18 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.36 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  23.29 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  23.84 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.08 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
441 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.79 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.79 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.49 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.79 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  23.78 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.79 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.07 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.31 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  27.97 
 
 
491 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  23.85 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.98 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.98 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.27 
 
 
410 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.19 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  20.08 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.19 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
412 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
428 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>