More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2120 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  100 
 
 
202 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  50.25 
 
 
197 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  45.03 
 
 
197 aa  159  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  49.24 
 
 
197 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  44.67 
 
 
199 aa  155  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.81 
 
 
217 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.06 
 
 
210 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.72 
 
 
216 aa  148  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.13 
 
 
213 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.35 
 
 
216 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.58 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  46.27 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  45.05 
 
 
688 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.34 
 
 
210 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.85 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.41 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.42 
 
 
207 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.53 
 
 
686 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.27 
 
 
703 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.74 
 
 
200 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.19 
 
 
210 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.38 
 
 
203 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.57 
 
 
213 aa  141  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.1 
 
 
686 aa  140  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.59 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.69 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.16 
 
 
707 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  41.43 
 
 
206 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.33 
 
 
205 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.18 
 
 
705 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.79 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  44.5 
 
 
210 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.72 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  43.6 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.28 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.41 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  40.89 
 
 
225 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  44.88 
 
 
207 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  44.5 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  40.39 
 
 
206 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40.37 
 
 
224 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.24 
 
 
206 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.46 
 
 
234 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.43 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  41.79 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  41.92 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  41.92 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.29 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.66 
 
 
207 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  44.67 
 
 
662 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  43.19 
 
 
215 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  39.81 
 
 
237 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  40.29 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  39.8 
 
 
206 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  51.8 
 
 
217 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.64 
 
 
688 aa  134  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.48 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  41.41 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  42.19 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  40.09 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  50.66 
 
 
217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  45.88 
 
 
209 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  42.03 
 
 
209 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43 
 
 
214 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  52.55 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  42.21 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40.91 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.16 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  43.13 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  43.13 
 
 
212 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.9 
 
 
215 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  43.13 
 
 
212 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.13 
 
 
217 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.65 
 
 
213 aa  131  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  41.62 
 
 
226 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.13 
 
 
217 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  44 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.27 
 
 
671 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  38.53 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.06 
 
 
212 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.06 
 
 
217 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.2 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.09 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.61 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  38.81 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  42.86 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.61 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.37 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.29 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  39.8 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  44.55 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.8 
 
 
210 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  36.71 
 
 
209 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>