More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0543 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  57.89 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  58.6 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  56.34 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  56.76 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  56.4 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  60.09 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  63.16 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  55.92 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  56.56 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  59.69 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  55.24 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  54.5 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  53.99 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  54.81 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  59.28 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  58.21 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  52.11 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  58.65 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  52.23 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  54.07 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  50.52 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  50 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  50.25 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.08 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.62 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.85 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.44 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.7 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 686 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.06 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 208 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.08 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.92 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.17 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  46.56 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  40.71 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.46 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 688 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.73 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 210 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.69 
 
 		 703 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 686 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 705 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.24 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.41 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  40.58 
 
 		 688 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  43 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  43 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 200 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.41 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.33 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>