More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1277 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  72.36 
 
 		 207 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  64.14 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  64.36 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  51.17 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  48.53 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  51.81 
 
 		 240 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.94 
 
 		 244 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.34 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  49.75 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.62 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  47.47 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.68 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  45.65 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.1 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  42.06 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  38.81 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 230 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.55 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.63 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  40.44 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  45.85 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.8 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  44.66 
 
 		 210 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  40.38 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.53 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  42.58 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  37.7 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.44 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.32 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  39.8 
 
 		 688 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  45.9 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 686 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  35.61 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.03 
 
 		 210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  39.15 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  36.84 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  40 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.51 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.79 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.03 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  33.17 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  35.55 
 
 		 209 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  38.65 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.33 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>