More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1454 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  55.56 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.76 
 
 
209 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  54.92 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  50.5 
 
 
226 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  48.31 
 
 
236 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  53.14 
 
 
214 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  49.28 
 
 
225 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  51.92 
 
 
225 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  49.04 
 
 
230 aa  191  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  50 
 
 
230 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  53.4 
 
 
244 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  48.54 
 
 
218 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  47.8 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  49.51 
 
 
226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  54.74 
 
 
244 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  47.34 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  47.39 
 
 
234 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  52.11 
 
 
226 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  49.73 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  52.08 
 
 
240 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  50.24 
 
 
233 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  44.71 
 
 
209 aa  174  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  44.76 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46 
 
 
207 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  47.32 
 
 
221 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  48.08 
 
 
230 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  51.49 
 
 
252 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.4 
 
 
218 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.13 
 
 
199 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.97 
 
 
210 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  46.83 
 
 
205 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.42 
 
 
210 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.54 
 
 
210 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.69 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.4 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.94 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.4 
 
 
210 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44.68 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  52.13 
 
 
246 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.03 
 
 
207 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  49.28 
 
 
217 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.79 
 
 
210 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.31 
 
 
688 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.18 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.27 
 
 
212 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.46 
 
 
217 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.79 
 
 
204 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.48 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.37 
 
 
217 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.37 
 
 
217 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  45.85 
 
 
217 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.91 
 
 
210 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.18 
 
 
211 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.84 
 
 
219 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  45.15 
 
 
210 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.85 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.44 
 
 
213 aa  155  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  38.54 
 
 
208 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.28 
 
 
210 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  44.44 
 
 
210 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44 
 
 
214 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.96 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.62 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  45.27 
 
 
208 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  46.19 
 
 
212 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  38.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.02 
 
 
208 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  46.2 
 
 
203 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  43.94 
 
 
208 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.23 
 
 
688 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  44.62 
 
 
210 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.34 
 
 
213 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.56 
 
 
705 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  37.07 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  37.07 
 
 
208 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.54 
 
 
686 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  37.07 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.78 
 
 
686 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.98 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.06 
 
 
208 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  44.72 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.94 
 
 
223 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.94 
 
 
223 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  42.44 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.51 
 
 
219 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.15 
 
 
703 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43 
 
 
207 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.64 
 
 
224 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.46 
 
 
206 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.18 
 
 
206 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.63 
 
 
217 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  40.95 
 
 
215 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  41.67 
 
 
203 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>