More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3591 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  65.84 
 
 		 207 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  64.14 
 
 		 208 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  62.84 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  49.06 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  45.89 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.87 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  44.44 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  48.47 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.18 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.05 
 
 		 244 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.31 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  46.27 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.97 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  44.71 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.46 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.71 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  38.86 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.06 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.39 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.2 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  43.5 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  43 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.52 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 705 aa  141  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.27 
 
 		 204 aa  141  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.71 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.91 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  38.21 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  42.5 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.67 
 
 		 703 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  37.86 
 
 		 208 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  38.24 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.67 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.63 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  41.5 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37.37 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  44.12 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  39.53 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>