More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2144 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  100 
 
 		 199 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  69.04 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  61.86 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  62.89 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  53.27 
 
 		 208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  48.74 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  48.24 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  48.73 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  47 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  47.55 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.32 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.8 
 
 		 244 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.8 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48.21 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.42 
 
 		 244 aa  158  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  48.7 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  46.46 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  45.5 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  49.46 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.5 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.29 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  43 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  49.23 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  47.78 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.22 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  46.94 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.95 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.69 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.1 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.41 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  42.27 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 707 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.7 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 223 aa  141  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 705 aa  141  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  45.96 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.19 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.71 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.03 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  44.9 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.68 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.32 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  44.74 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  40.44 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  40.59 
 
 		 244 aa  138  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.56 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 226 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.19 
 
 		 688 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  44.07 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 901 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  39.13 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  39.04 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>