More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1510 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  64.98 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  66.67 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  68.57 
 
 		 214 aa  285  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  67 
 
 		 217 aa  284  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  60.29 
 
 		 223 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  56.6 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.88 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  39.62 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.09 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.71 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.38 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  41.38 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.15 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  41.98 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  41.04 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.63 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  41.78 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.45 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.84 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  40.1 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  42.58 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.53 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.44 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  41.55 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.88 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  37.9 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  37.96 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  38.46 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  36.04 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  37.91 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 901 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.19 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  39.25 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.56 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  35.74 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.54 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.26 
 
 		 686 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  37.61 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  38.05 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.27 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  39.23 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  35.24 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.15 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37.26 
 
 		 671 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  37.85 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  34.56 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  36.11 
 
 		 707 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35.07 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  40.62 
 
 		 199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  38.74 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  37.63 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  36.92 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  37.5 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  37.21 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  39.81 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  34.27 
 
 		 662 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1962  thymidylate kinase  35.61 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  36.24 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  37.74 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  34.12 
 
 		 688 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  36.13 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  40 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>