More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1870 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  54.4 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  50.47 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  48.78 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  53.09 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.58 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.55 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  53.03 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.51 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.51 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  51.55 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  50 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  49.05 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.41 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.28 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  48.82 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.94 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.16 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  46.28 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.5 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 705 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 252 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  50.53 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  50 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  51.04 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  48.56 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 226 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 226 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.55 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.97 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.28 
 
 		 703 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.24 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 901 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.08 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  45.85 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  49.74 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  45 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.44 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  48.69 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  45 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  48.69 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 688 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.93 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  42.92 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>