More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0128 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  57.42 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  56.07 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  57.56 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  51.94 
 
 		 214 aa  216  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  51.89 
 
 		 215 aa  214  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  52.79 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  52.15 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  52.53 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  50.99 
 
 		 671 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  52.36 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  54.74 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 202 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 686 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  49.49 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 686 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.29 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  49.76 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  46.73 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  46.98 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.08 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 707 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  48.13 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  50.46 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.38 
 
 		 204 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.74 
 
 		 688 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 688 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  52.36 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.48 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.27 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  46.4 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 901 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.81 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  49.73 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.89 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.64 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  42.99 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  45.5 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.41 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  47.06 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.75 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  39.9 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.45 
 
 		 703 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.65 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 705 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  46.19 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  46.7 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.02 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  45.33 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.15 
 
 		 199 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.67 
 
 		 197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.11 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.39 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 204 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 209 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>