217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2465 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 		 403 aa  780    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  45.43 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  43.68 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  44.83 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  41.22 
 
 		 419 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  43.14 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  43.14 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  43.14 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  41.51 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  41.03 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  39.89 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  40.9 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  40.9 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  40.9 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  39.3 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  40.54 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  41.08 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  41.08 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  40.81 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  40.81 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  41.05 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  41.46 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  33.74 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  34.53 
 
 		 424 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  33.99 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  35.73 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  34.54 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  34.91 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  33.81 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  34.05 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  35.34 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  35.34 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  33.51 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  34.56 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  35.57 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  33.92 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  37.12 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  34.3 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  35.05 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  34.79 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  32.38 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  35.57 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  33.25 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  34.54 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  34.56 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  35.31 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  32.23 
 
 		 459 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  37.57 
 
 		 422 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  32.23 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  33.68 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  34.25 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  33.16 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  34.04 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  32.39 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  34.1 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  33.85 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  32.59 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.32 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.77 
 
 		 634 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 1049 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.35 
 
 		 1131 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  27.56 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.95 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.83 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.83 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.22 
 
 		 645 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.8 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.41 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  24.73 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.83 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.99 
 
 		 626 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.49 
 
 		 1170 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.61 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.64 
 
 		 1124 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.56 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  26.97 
 
 		 624 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1016  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.28 
 
 		 1170 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.93 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  24.01 
 
 		 618 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  28.14 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  27 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.59 
 
 		 620 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>