More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0928 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  76.55 
 
 		 479 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  876    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  36.32 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  35.68 
 
 		 476 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  35.68 
 
 		 483 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 466 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 594 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.79 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.09 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 478 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  26.34 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 477 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 		 522 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 		 524 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 512 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.7 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 514 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 485 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 480 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.56 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 569 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 516 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 544 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  24.5 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.14 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.9 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.45 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.26 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  26.33 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 532 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 635 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.72 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29.59 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.38 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 511 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.89 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>