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for query gene Mboo_0388 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  907    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  89.48 
 
 		 466 aa  778    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 594 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  35.78 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  35.71 
 
 		 476 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  35.65 
 
 		 483 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  25.28 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 465 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.63 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.63 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.89 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.63 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.32 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.63 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.63 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.72 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.84 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.55 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 487 aa  99.8  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.79 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  26.48 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 558 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  26.61 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 		 546 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  25.6 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.39 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 494 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 528 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 537 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.84 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.06 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.84 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 538 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 529 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 531 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.4 
 
 		 466 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 523 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.73 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 496 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 539 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 531 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 531 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.68 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.07 
 
 		 549 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 646 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  22.81 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.1 
 
 		 529 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 531 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 790 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 		 624 aa  87.4  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.13 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 504 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 		 526 aa  87  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 504 aa  86.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.13 
 
 		 503 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 514 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.6 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.18 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  25.67 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.31 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.99 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.99 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
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NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.36 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.37 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.18 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.56 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
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