More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1264 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  89.48 
 
 		 466 aa  771    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 466 aa  910    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  55.73 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 594 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  34.77 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  34.77 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  34.91 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  25.62 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  26.47 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.59 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.83 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.83 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 478 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 469 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.34 
 
 		 478 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.23 
 
 		 509 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.17 
 
 		 512 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.24 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 479 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
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NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  25.6 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 488 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 488 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.77 
 
 		 528 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.43 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  27.97 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 790 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.99 
 
 		 509 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 525 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.08 
 
 		 503 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.08 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  27.29 
 
 		 535 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 538 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  24.51 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.21 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.76 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.25 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.26 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  22.64 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
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NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.67 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.81 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
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NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  24.63 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.23 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  25.21 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.43 
 
 		 592 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.63 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.71 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  22.2 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
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NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.68 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.93 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
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NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
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NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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