44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3303 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 414 aa  801    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  79.43 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  78.91 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  71.09 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  67.35 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  68.5 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  73.94 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  66.85 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  55.85 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 381 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  24.84 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 456 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.49 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  25.43 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  23.65 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  31.48 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  31.48 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  31.48 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.32 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2187  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.27 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>