120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2172 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  56.33 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 462 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1914  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.42815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2670  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3781  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1884  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 461 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  21.56 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  23.04 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  19.47 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  20.62 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  19.57 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  25.26 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  23.51 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.94 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.85 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  21.82 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  31.58 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.8 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.26 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.01 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  20.35 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  22.94 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  25.17 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.97 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.41 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  20.68 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.36 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  20.26 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.19 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  20.4 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2512  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>