88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1233 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  100 
 
 		 381 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  63.61 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  63.61 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  63.61 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  63.66 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  58.9 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  58.9 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  59.16 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  58.64 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  58.64 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  59.16 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  59.74 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  50.27 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  51.83 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  48.27 
 
 		 409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  48.66 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  49.86 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  47.41 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  49.47 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  49.47 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  46.87 
 
 		 394 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  48.21 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  48.21 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  48.21 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  48.21 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  47.93 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  46.01 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  46.01 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  46.01 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  46.01 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  46.01 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  46.01 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  46.01 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  46.01 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  45.48 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  46.41 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  32.52 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  35.25 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  29.13 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.31 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  27.11 
 
 		 456 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.09 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.34 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  34.92 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  33.08 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.34 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>