249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0636 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  48.85 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  26.55 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  26.5 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.84 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  22.87 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  24.8 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  27.27 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  22.19 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  28.26 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25.62 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  34 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  28.74 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  30.63 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.16 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.01 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  31.94 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.46 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.01 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  23.06 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  29.78 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.78 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  22.68 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.2 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.08 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  21.16 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  21.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  21.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.86 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  23.81 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  21.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.81 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  32.84 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  21.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  21.58 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  23.45 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>