186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01929 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01929  transport protein  100 
 
 		 402 aa  765    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  53.76 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  53.91 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  42.86 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  39.79 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.46 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.87 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  27.8 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  27.4 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  27.39 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  35.11 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  38.05 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  32.26 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  42 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  37.11 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  43.06 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  32.46 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  33.11 
 
 		 424 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  33.11 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  33.11 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.67 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 487 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  37.8 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.57 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  38.98 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  37.82 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  28.44 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.57 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  30.16 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 495 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>