147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0719 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  100 
 
 		 387 aa  731    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  59.63 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  40 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  43.89 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  41.5 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  42.03 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  33.06 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  38.52 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  38.52 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  38.52 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  38.52 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  38.52 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  35.29 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  32.33 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  30 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  36.07 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  36.07 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  40.62 
 
 		 591 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  36.04 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  28.07 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 398 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 417 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2834  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.161875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  34.55 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.42 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  28.81 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  29.17 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.95 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  26.82 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  28.33 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>