More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3681 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 416 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  58.4 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  50.66 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  26.25 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  26.23 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.68 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  23.84 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.56 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  24.5 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  32.84 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  22.87 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  20.73 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.47 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  21.37 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  26.63 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  23.06 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  26.24 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  28.1 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  25.89 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  23.82 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.17 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  21.39 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.44 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.38 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  24.34 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.83 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  20.49 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.23 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>