12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2834 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2834  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  809    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.161875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3771  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0593  permease  27.59 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.046063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  20.83 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 476 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>