25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3771 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3771  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0593  permease  30.27 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.046063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2834  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.161875 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  24.57 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  23.86 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  23.21 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  25.3 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  20.98 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  22.26 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.91 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.05 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>