More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0693 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 405 aa  801    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  57.44 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  43.7 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  43.7 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  43.7 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  43.7 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  43.7 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  43.6 
 
 		 409 aa  345  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  45.5 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  45.5 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  45.25 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  45.25 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  45.25 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  40.69 
 
 		 411 aa  326  6e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 400 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  42.39 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  40.51 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  43.19 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 399 aa  299  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  39.6 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  41.4 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  41.15 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  41.75 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  40.9 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  40.25 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  35.62 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 413 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 423 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.13 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 487 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  33.75 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  33.99 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  32.74 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  32.99 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  28.75 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  30.51 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.39 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.39 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.5 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.32 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.75 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.3 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.59 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.85 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.67 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.36 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.67 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>