More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0424 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  87.06 
 
 		 410 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  99.5 
 
 		 403 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 		 403 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  70.65 
 
 		 406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  71.76 
 
 		 397 aa  569  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  70.96 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  68.02 
 
 		 397 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 		 400 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  60.1 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  59.85 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  60.1 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  60.1 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  60.1 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  59.95 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  61.07 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  61.32 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  61.07 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  61.58 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  61.32 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 410 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  46.05 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  47.78 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  45.95 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  45.95 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  46.21 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  45.69 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  45.69 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  44.09 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  41.92 
 
 		 404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  43.19 
 
 		 405 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  40.26 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  41.1 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  40.16 
 
 		 487 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  44.09 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.36 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 416 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 418 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  39.77 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 410 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  35.79 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  36.04 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 407 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.56 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.85 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 387 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 421 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.86 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.6 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.63 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  29.27 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.94 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.97 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.32 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.97 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.61 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.97 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>